洛宇生物,爲人類更健康!
咨詢熱線:18008719438 / 18887132162 lysw@labreal.cn lzx@labreal.cn

聯系我們contact
18008719438(楊老師 - 業務)
18887132162(高老師 - 人事(shì))
lysw@labreal.cn;lzx@labreal.cn
昆明市盤龍區龍泉路871号茨壩生物創新中心B座2層

TMT标記定量蛋白質組學(xué)

目    錄
  • 産品介紹
  • 常見問題
  • 經(jīng)典案例
  • 結果展示

背景簡介 
 TMT™(Tandem Mass Tag™)技術是由美國(guó)Thermo Scientific公司研發(fā)的一種(zhǒng)多肽體外标記技術。該技術采用10種(zhǒng)同位素的标簽,通過(guò)特異性标記蛋白多肽N末端或賴氨酸側鏈基團,而後(hòu)進(jìn)行串聯質譜分析,可同時(shí)比較10組不同樣品中蛋白質的相對(duì)含量。TMT技術是常用的差異蛋白質組學(xué)技術,在疾病标記物篩選、藥物作用靶點、動植物抗病/抗脅迫機制、動植物發(fā)育分化機理等領域都(dōu)有廣泛應用。
 
技術優勢 
靈敏度高:低豐度蛋白也能(néng)檢測出
适用範圍廣:幾乎可對(duì)任何物種(zhǒng)的各類蛋白質進(jìn)行分離鑒定
高通量:能(néng)同時(shí)對(duì)10組樣本中包含的蛋白進(jìn)行鑒定及表達差異分析
高效:液相色譜與串聯質譜連用,自動化操作,分析速度快,分離效果好(hǎo)
 
技術路線 
 
分析内容 
 
 
樣本類型 
細胞,組織,尿液,全血,血清,血漿,總蛋白等
建議總蛋白起(qǐ)始量(單次):≥ 500 μg,濃度≥1μg/μL
 

Q1:iTRAQ及TMT等标記定量蛋白質組技術有什麼(me)特點?
A:iTRAQ以及TMT等标記定量蛋白質組技術分辨率高,細胞樣品最多可鑒定超過(guò)6000個蛋白,并且絕大多數蛋白都(dōu)有定量和定性信息;其次是通量高,可以一次最多完成(chéng)8個(iTRAQ)或者10個(TMT)樣品的實驗,特别适合于多組樣品間的同時(shí)比較以及生物學(xué)過(guò)程的動态檢測。
Q2:沒(méi)有全基因組數據的物種(zhǒng)該如何進(jìn)行蛋白的鑒定? 
A:對(duì)于已經(jīng)公布全基因組序列的物種(zhǒng),可以在得到全序列後(hòu)構建本地建庫并進(jìn)行本地檢索;對(duì)于未進(jìn)行全基因組測序的物種(zhǒng),可以采用近緣物種(zhǒng)的數據庫或者EST數據以及轉錄組數據進(jìn)行檢索。
 

環境溫度升高對(duì)微生物群落的影響
研究背景 
全球溫度升高會(huì)對(duì)微生物群落造成(chéng)影響,進(jìn)而直接影響全球生态系統。科學(xué)家們在溫度對(duì)微生物群落的群落結構和特定的代謝過(guò)程做了許多研究,而較少使用組學(xué)手段對(duì)整個群落的反應做出全面(miàn)的評估。

研究内容 
本文首次將(jiāng)TMT标記定量蛋白質組學(xué)技術應用在微生物群落研究上,精确地和可重複地在40℃、43℃和46℃三個溫度條件下定量到上千個微生物蛋白質。作者發(fā)現,溫度升高會(huì)引起(qǐ)單個微生物和整個群落的氨基酸代謝相關蛋白質上調,并抑制兩(liǎng)類螺菌屬微生物的固碳蛋白表達,然而在高溫下第三類螺菌屬微生物固碳蛋白則顯著上調。


研究結果 
定量蛋白質組學(xué)技術可以用于群落微生物研究,能(néng)鑒定到與代謝、生長(cháng)、信号與壓力反應等過(guò)程相關的上千個差異表達蛋白,并在生态群落中對(duì)單個微生物組實現定量蛋白質組學(xué)研究。
參考文獻 
Mosier A C, Li Z, Thomas B C, et al. Elevated t emperature alt ers proteomic responses of ind ividual organisms within a bio film community. The ISME journal. 9:180-194 (2015). (IF: 9.328)

掃碼反饋

掃一掃,反饋當前頁面(miàn)

咨詢反饋
掃碼關注

微信公衆号

返回頂部