中美貿易摩擦升級，國(guó)内企業如何破局？
2019年5月9日，美國(guó)政府宣布自2019年5月10日起(qǐ)，對(duì)從中國(guó)進(jìn)口的2000億美元清單商品加征的關稅稅率由10%提高到25%。5月13日，國(guó)務院關稅稅則委員會(huì)決定，自2019年6月1日起(qǐ)，對(duì)原産于美國(guó)的部分進(jìn)口商品提高加征關稅稅率，其中診斷試劑（稅号：30063000）屬于加征25%關稅稅率的商品範圍。
中美貿易摩擦持續升級，國(guó)内企業如何破局？2018年3月美國(guó)總統特朗普正式簽署對(duì)華貿易備忘錄，中美貿易戰正式拉開(kāi)帷幕。聯川生物順勢而行，随即積極布局國(guó)内市場，戰略性將(jiāng)美國(guó)LC Sciences國(guó)際研發(fā)中心基因捕獲平台落地國(guó)内，打破基因捕獲核心技術長(cháng)久被外企壟斷的現象，爲國(guó)内企業提供高性價比一站式基因檢測解決方案。
全球領先的寡核苷酸生産和供應商
美國(guó)LC Sciences（www.lcsciences.com）成(chéng)立于2004年，聯川生物國(guó)際研發(fā)中心，全球領先的寡核苷酸生産和供應商，全球5家擁有基因測序上遊核心技術的公司之一，發(fā)明專利32項。公司生産的産品和服務遍及全球40多個國(guó)家，上萬家單位和科研機構，依托自主μParaflo®微流體芯片合成(chéng)寡核苷酸，推進(jìn)基因捕獲等領域的技術革新和發(fā)展。
自主技術包含μParaflo®微流體芯片平台，大規模寡核苷酸OligoMix®，一步式多重PCR解決方案VariantPro™，液相雜交捕獲解決方案VariantBaits™等多種(zhǒng)創新技術。
雙V捕獲平台臨床NGS定制化試劑盒供應商
聯川基因診斷創立于2016年，聯川生物全資子公司，定位于體外診斷試劑盒開(kāi)發(fā)與應用，將(jiāng)美國(guó)LC Sciences研發(fā)中心強大的雙V捕獲平台（VariantPro™&VariantBaits™）在國(guó)内GMP工廠落地生産，提供臨床NGS定制化一站式檢測解決方案。基于全球首創的VariantPro™一步法靶向(xiàng)基因捕獲技術和自主知識産權的VariantBaits™液相雜交捕獲系統，聯川基因診斷專注爲國(guó)内精準醫學(xué)領域提供先進(jìn)的基因檢測解決方案和産品。
VariantBaits™液相雜交捕獲系統
VariantBaits™液相雜交捕獲系統可以對(duì)感興趣的蛋白編碼區域DNA或基因組上的特定序列進(jìn)行富集，并在Illumina、Ion Torrent等二代測序平台進(jìn)行高通量測序。通過(guò)自主專利的μParaflo®微流體芯片合成(chéng)的高質量超長(cháng)RNA探針，對(duì)帶有測序接頭的基因組文庫進(jìn)行液相雜交，與目标區域序列互補配對(duì)的探針在雜交時(shí)特異性結合目的片段DNA，通過(guò)鏈黴親和素磁珠與探針上的生物素标記結合，從而抓取并富集目的片段DNA。
μParaflo® Microfluidics工業級核酸合成(chéng)解決方案
根植于光原位合成(chéng)原理，聯川研發(fā)出以矽晶闆爲基礎的大規模合成(chéng)芯片平台μParaflo® Microfluidics，是目前少數幾家擁有此項技術的公司。通過(guò)微流控技術對(duì)核酸的原料進(jìn)行控制，經(jīng)由控制光的封閉與否對(duì)合成(chéng)的DNA反應進(jìn)行控制，達到合成(chéng)DNA的目的。相比于其他方式，此種(zhǒng)DNA合成(chéng)可以實現更大規模的合成(chéng)以及更可控的DNA合成(chéng)質量。
在合成(chéng)DNA時(shí)，當長(cháng)度小于1000bp時(shí)，芯片合成(chéng)成(chéng)本遠低于其他合成(chéng)方式。以此表明，在大規模合成(chéng)DNA的領域當中，芯片合成(chéng)占有絕對(duì)優勢，也是主流選擇。
Kosuri, S., & Church,G. M. (2014). Large-scale de novo DNA synthesis: technologies and applications.Nature methods, 11(5), 499.
μParaflo® Microfluidics芯片平台可一次性合成(chéng)30,000根寡核苷酸，可實現大規模探針合成(chéng)，更适用于二代測序靶向(xiàng)捕獲。μParaflo® Microfluidics平台自2004年以來發(fā)表數十篇文章，其中多篇發(fā)表在CNS頂級雜志上。（文章見文末列表）
VariantBaits™探針優勢
結合力優勢：RNA/DNA>DNA/DNA
RNA探針對(duì)基因組文庫（DNA）結合力更強，這(zhè)使得RNA探針相比于DNA探針具有更低的退火溫度，實驗中更好(hǎo)的穩定性。
設計優勢：覆瓦式和長(cháng)探針
探針長(cháng)度和探針設計排布的策略對(duì)捕獲效率有更多的影響，覆瓦式（Tiling）的探針設計比相鄰式或間隔式的探針排布富集效率更高；長(cháng)探針在捕獲時(shí)對(duì)目标序列的錯配容忍度更高，因此長(cháng)探針在捕獲indels上靈敏度更高。
Clark, Michael J., et al."Performance comparison of exome DNA sequencing technologies." Naturebiotechnology 29.10 (2011): 908.3
VariantBaits™技術優勢
國(guó)内唯一一家大規模自主核心技術的探針合成(chéng)平台，探針可靠性已獲數十項應用驗證
120nt超長(cháng)RNA捕獲探針覆瓦式覆蓋目标區域，擁有更高的錯配容忍度和捕獲效率
獨特的探針設計優化，充分利用探針與捕獲區域的結合特性，減少冗餘産生
對(duì)于高GC區域，進(jìn)行獨特的探針方法設計，最大限度上捕獲到高GC區域
可按客戶需求個性化定制Panel，Panel定制30個工作日，可同時(shí)定制多種(zhǒng)Panel
VariantBaits™性能(néng)展示
VariantBaits™良好(hǎo)的捕獲效率
VariantBaits™優異的覆蓋度
VariantBaits™均一化的覆蓋度
VariantBaits™穩定的重複表現
VariantBaits™産品性能(néng)
VariantBaits™建庫原理
VariantBaits™定制流程
VariantBaits™部分合作成(chéng)果
1.Gao X, Church, GM, et al. (2004) Accurate multiplex gene synthesis from programmable DNA chips. Nature 432, 1050-1054.
2.Porreca GJ, Zhang K, Li JB, Xie B, Austin D, Vassallo SL, LeProust EM, Peck BJ, Emig CJ, Dahl F, Gao Y, Church GM, Shendure J. (2007) Multiplex amplification of large sets of human exons. Nat Methods 4(11), 931-36.
3.Gnirke A, Melnikov A, Maguire J, et al. (2009) Solution hybrid selection with ultra-long oligonucleotides for massively parallel targeted sequencing. Nat Biotechnol 27, 182–89.
4.Lira Mamanova, Alison J Coffey1, et al. (2010) Target-enrichment strategies for nextgeneration sequencing. Nat Methods 7(2):111-8.
5.Teer JK, Bonnycastle LL, et al. (2010) Systematic comparison of three genomic enrichment methods for massively parallel DNA sequencing. Genome Res 20(10), 1420-31.
6.Matzas M, St?hler PF, et al. (2010) High-fidelity gene synthesis by retrieval of sequence-verified DNA identified using high-throughput pyrosequencing. Nat Biotechnol 28(12), 1291-94.
7.Nautiyal S, Carlton VE, Lu Y, Ireland JS, Flaucher D, Moorhead M, Gray JW, Spellman P, Mindrinos M, Berg P, Faham M. (2010) High-throughput method for analyzing methylation of CpGs in targeted genomic regions. Proc Natl Acad Sci 107(28), 12587-92.
8.Myllykangas S, Buenrostro JD, et al. (2011) Efficient targeted resequencing of human germline and cancer genomes by oligonucleotide-selective sequencing. Nat Biotechnol 29, 1024-27.
9.Diep D, Plongthongkum N, Gore A, Fung H, Shoemaker R, Zhang K. (2012) Library-free methylation sequencing with bisulfite padlock probes. Nature Methods 9(3), 270-2.
10.Labrie V, Buske OJ, Oh E, Jeremian R, Ptak C, Gasiūnas G, Maleckas A, Petereit R, ?virbliene A, Adamonis K et al.(2016) Lactase nonpersistence is directed by DNA-variation-dependent epigenetic aging. Nature Structural &Molecular Biology 23(6):566-73.
11.Zaccai F, C T, Savitzki D, Zivony-Elboum Y, Vilboux T, Fitts EC, Shoval Y, Kalfon L, Samra N, Keren Z. (2017) Phospholipase A2-activating protein is associated with a novel form of leukoencephalopathy. Brain 140(2), 370-386.
