背景簡介
RNA immunoprecipitation sequencing (RIP-seq)是RNA免疫共沉澱結合高通量測序的一種(zhǒng)技術,通過(guò)免疫沉澱靶蛋白來捕獲互作的RNA。其原理是運用針對(duì)目标蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白複合物沉澱下來,然後(hòu)經(jīng)過(guò)分離純化獲得結合在複合物上的RNA,再通過(guò)高通量測序實現對(duì)目的RNA的信息分析。RIP技術與高通量測序的結合,能(néng)幫助研究人員從全基因組層面(miàn)了解轉錄後(hòu)調控網絡的動态過(guò)程。
技術優勢
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多年經(jīng)驗總結抗體特性,保證高IP成(chéng)功率
分析流程
分析内容
樣本類型
個體較小動物如小鼠、雛雞、斑馬魚等肝髒、心髒、腦等組織>1g;
個體較大動物如豬、牛、羊等肌肉、晚期胚胎等組織>2g,脂肪組織>10g;
昆蟲等整隻個體>3g;
腫瘤組織>1g;
植物組織:果實>10g,花序、花蕊、花粉>2g,其他部位>5g;
細胞樣本>1×108個
Peak 在基因功能(néng)元件上的分布
peak 以及周邊基因結構的可視化
motif 分析