實時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)是一種(zhǒng)以PCR反應爲基礎的DNA定量技術,通過(guò)對(duì)目标基因在擴增過(guò)程中産生的拷貝數進(jìn)行實時(shí)的定量,從而達到對(duì)目的基因的定性和定量分析。現有兩(liǎng)種(zhǒng)常用的方法對(duì)PCR産物進(jìn)行熒光定量:一種(zhǒng)是利用熒光染料與雙鏈DNA結合,通過(guò)熒光強度進(jìn)行熒光定量;另一種(zhǒng)是利用攜帶了熒光報告基因的特異性DNA探針對(duì)目标基因進(jìn)行定量。
常用熒光染料有:SYBR GreenⅠ、EvaGreen、LC Green等
Taqman熒光探針作爲定量檢測的首選,是一種(zhǒng)寡核苷酸,充當DNA複制的起(qǐ)點,熒光基團連接在探針的5'末端,淬滅劑連接在3'末端。PCR擴增時(shí)加入引物和探針,探針完整時(shí),報告基團發(fā)射的熒光信号被淬滅基團吸收;PCR擴增時(shí),探針酶切降解,報告熒光基團與淬滅熒光基團分離,熒光信号被系統檢測接收,每擴增一條DNA鏈伴随一個熒光分子形成(chéng),實時(shí)熒光信号的累積與PCR産物同步進(jìn)行,實現實時(shí)定量的實驗結果。相對(duì)于SYBR熒光染料具有序列特異性,直結合到互補區的強靈敏度。相較于雜交探針,其隻需設計一條探針,既方便也能(néng)完成(chéng)定量PCR要求。
獲得遊離5,-羟基→合成(chéng)DNA原料→帶帽(capping)反應→轉化爲穩定磷酸三酯→重複步驟4
探針引物設計實驗流程:
目的基因查找比對(duì)→探針與引物設計→合成(chéng)
熒光定量QPCR實驗流程:
取材→RNA提取逆轉錄成(chéng)cDNA→實時(shí)熒光定量PCR-(QPCR産物電泳)→數據分析
基因名稱和種(zhǒng)屬、或已知探針引物序列、或基因ID号
熒光定量QPCR送樣運輸要求:
組織、細胞:-80℃保存,幹冰運輸;
血液:EDTA抗凝管,4℃運輸;
RNA樣本:體積≥10 μL,幹冰運輸。